・どのリポジトリをforkしていいかわからない 
よくある勘違い：
「ソース落としてくるんだからわからないってことはないだろう。どれどれ、ソースの落とし方は...っと」

$ repo init -u https://bitbucket.org/sola/jcrom_manifest -m jcrom_jb-master.xml
$ repo sync

「この'jcrom_manifest'ってリポジトリをforkすればいいんだな」
＿人人人人人人人人人人人人＿
＞　馬鹿め！それは残像だ　＜
￣^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^￣
manifestはrepoで落としてくるリポジトリの一覧を書いてあるだけなので、これをforkしても（大体の人には）いいことありません

Q. じゃあ、どれをforkすればいいの？
A. 一番手っ取り早いのは、修正したいソースのあるディレクトリで「git remote -v」

$ git remote -v
sola-android https://bitbucket.org/sola/jcrom_hoge_fuga.git (fetch)
... 

とか出てきたらそれがfork対象のリポジトリ
（remote名がsola-androidじゃなければ、AOSPのリポジトリになると思うのでbitbucketなりgithubなりに新規でリポジトリを作って頑張れ！）

あと、「jcrom_[親ディレクトリ]_[子ディレクトリ]」って命名規則でリポジトリ名をつけてるみたいなのでそれも参考にする
例：jcrom_packages_apps_settingsってリポジトリなら、repo syncすると$SOURCE_DIR/packages/apps/Settingsに展開される

・repo syncでコンフリクトした

だから作業するときはブランチ生やせってあれほど...
kernelを自分でビルドするとコンフリクトしやすいです
rebaseやらなんやら駆使して頑張るなり、あきらめて自分の変更点を捨てるなりお好きにどうぞ

・repo syncで取ってきた最新ソースが自分のリポジトリにpushできない

ブランチ確認しろ（git branch or repo branch）
自分のbitbucketのリポジトリをmyForkって名前でリモート登録してると仮定して、コマンド叩くと

$ git push myFork master
Already up-to-date. 

ってなると思う（masterはfork元に追随するために使ってる想定）
これ、repo syncで取ってきたコードは(no branch)になっちゃうのが原因
なので、repo sync後に最新のコードをmasterブランチに反映してからgit pushをしてやる
ブランチに反映するやり方がわからなかったら、そのリポジトリで

$ git pull sola-android master

やればいいと思うよ！

・その他
「こんなとこもハマりポイントで、回避方法はこうだよ！」っての教えてくれれば追記します。
（もしくは、ハマってるところがあれば分かる範囲で気まぐれに回答します）